Beyond dairy: Identification of dental enamel proteins in ancient human dental calculus
古代の歯石に含まれる歯のエナメル質由来のタンパク質を初めて同定し、従来の食生活や口腔内微生物の研究に加え、性別推定への新たな応用可能性を開拓した。
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evolutionary biology
460 件の論文
Tracing mobility among Eneolithic-Bronze Age Kurgan populations in the North Pontic steppe
本研究は、北黒海ステップの4〜3 千年紀のクルガン埋葬者におけるストロンチウム同位体分析などを通じて、同地域内での移動パターンを解明し、北黒海ステップの初となる同位体基準値のヒートマップを作成したものである。
Domestic dog introgression in Australian dingoes: environmental drivers and evolutionary consequences
オーストラリアのディンゴとイヌの交雑は人間活動や気候要因によって駆動され、嗅覚受容体遺伝子などにおける適応的交雑と有害変異に対する選択的排除の両方が生じていることが、ゲノム解析により明らかになった。
Genomebook: Mendelian inheritance as a structured parameterisation layer for LLM agent populations
本論文は、26 の行動特性を記述するメンデル遺伝モデルを LLM エージェント集団に導入し、選択圧下で遺伝的アーキテクチャが行動の進化を駆動し、非遺伝的ベースラインでは見られない動的変化を生み出すことを実証した「Genomebook」という進化システムの開発を報告するものである。
Vertical inheritance and loss-driven evolution of secretion systems in the bee gut microbiota
本研究は、ミツバチの腸内細菌叢における分泌システムの進化が、水平伝達よりも垂直遺伝と反復的な遺伝子欠失によって主に駆動されていることを明らかにし、これらが宿主への適応ではなく細菌間相互作用の維持に寄与していることを示しています。
Inferring the multi-host fitness landscape of endive necrotic mosaic virus from cross-inoculation experiments
この論文は、魚の幾何学モデルとベイズ推論を組み合わせてエンドウモザイクウイルスの多宿主適応度地形を推定し、宿主間の許容性の不均一性や系統関係との一致を明らかにする手法を提案している。
Diatom Endosymbionts have Shrinking but Stable Genomes Despite Low Coding Density
この論文は、珪藻の窒素固定共生体（SB）がホストとの相互作用に関与する遺伝子や細胞分裂制御の鍵となる遺伝子に正の選択を受けている一方で、移動要素の早期喪失など既存モデルとは異なる特徴を示しつつ、比較的初期段階のゲノム縮小と安定性を維持していることを明らかにしたものである。
Ineffectual Genomic Error Correction Under Environmental Perturbation Dynamically Regulates Mutational Supply and Robustness
この論文は、環境変化がキネティック・プルーフリーディング酵素の駆動速度定数を変化させ一時的に複製エラー率を上昇させることで、停滞と急速な適応を交互に生み出す分子メカニズムを解明し、これが遺伝的変異供給と耐性のバランスを通じて長期的な進化の回復力を制約することを示しています。
Additive Channels in Curved Fitness Landscapes
本論文は、適応度地形の曲率の影響が相対的に小さい「加法的チャネル」と呼ばれる領域に集団が存在する可能性を提唱し、遺伝的分散の線形項と曲率項の寄与を比較する「加法性指数」を開発することで、なぜ非線形な相互作用が存在するにもかかわらず加遺伝モデルが進化を予測できるのかを説明する枠組みを構築しています。
Adaptive receptor expression and the emergence of disease as loss of signaling homeostasis
この論文は、受容体の適応的発現動態が恒常性維持の補償メカニズムとして機能し、慢性的なストレスによりその限界を超えた際に病気が発現するという仮説を提示し、複雑な慢性疾患の理解や薬剤動態のモデル化への示唆を論じています。
Using a simplified Rough Mount Fuji model to disentangle how multi-peaked fitness landscapes can be highly navigable
本研究は、Rough Mount Fuji モデルの簡略化版を用いた解析により、適応歩行が局所的なルールに基づきながらも、低中程度の適応度領域の存在やピーク遷移確率の低さ、そして勾配による高速な通過といった 3 つの要因により、多峰性の適応度地形において上位のピークへ到達しやすいメカニズムを解明し、この原理が実証的な folA 遺伝子の地形にも当てはまることを示した。
Ancestral state reconstruction with discrete characters using deep learning
本論文は、尤度関数が解析的に扱いにくい複雑な進化モデルにおいても適用可能な深層学習ベースの祖先状態再構成手法「phyddle」を開発・評価し、ベイズ推論との比較や実データへの適用を通じてその有効性と限界を明らかにしたものである。
Heterosis in crosses between remnant populations of a rare prairie forb: implications for restoration genetics
この研究は、希少な Prairie 植物の個体群間交配が野外環境で強い雑種強勢（ヘテロシス）を示すことを実証し、地域混合由来の種子供給戦略が生態系復元において有効であることを示唆しています。
Dosage compensation and meiotic sex chromosome inactivation are maintained in the absence of selection
この研究は、オスへの自然選択が緩んだ単為生殖の昆虫において、X 染色体の用量補償と減数分裂性染色体不活化が数百万年にわたって維持され、むしろ後者が強化されることを示し、これらのメカニズムが強い進化的制約や多面性によって維持されている可能性を明らかにしました。
Meta-analysis reveals the tempo of evolutionary parallelism of local adaptation between native and introduced ranges of plant species
このメタ分析研究は、植物の侵入範囲における局所適応の進化的平行性が、導入後時間の経過とともに、特にクラインの方向性の整合性が高まることで強まり、初期の遺伝的浮動を経てその後の自然選択によって達成される二段階のプロセスを経ることを明らかにした。
Phylogenetics, trait covariance analysis, and the evolution of fin and body shape in the surgeonfishes
本研究では、新たな系統信号を考慮した共分散解析手法を用いてイソギンチャクウオ科の形態進化を調査し、頭部と体形の食性との関連性、尾びれと胸びれの形状における運動機能のトレードオフ、および食性と運動要求が尾びれの共変異に及ぼす影響を明らかにしました。
Parental rejection is associated with extended lifespan in owl monkeys in captivity
飼育下でのオマキザルの親による子離れ（育児放棄）は、通常は子にとって致命的であるにもかかわらず、その親および育てられた子孫の寿命が有意に延長し、これは親の投資配分の戦略的変化と関連していることが示されました。
Assembling a fully-dated complete tree of life
本研究では、従来の二次的な計算コストの制約を打破する線形スケーリングの新しい分岐年代補間アルゴリズムを開発し、230 万種の現存種を含む完全な分岐年代付きの生命の樹を構築するとともに、その有用性を生命の樹全体の系統的多様性の推定を通じて実証しました。
Phenotypic plasticity evolved for climate variability constrains performance under climate warming
気候変動への適応として進化してきた表現型の可塑性は、温暖化環境では成長を阻害するトレードオフをもたらすため、必ずしも適応的ではなく、温暖化が進む世界では可塑性が低い温暖適応型の遺伝子型が有利になる可能性があります。
The effect of chronic, latent Toxoplasma gondii infection on human behavior: Testing the parasite manipulation hypothesis in humans
トキソプラズマ感染が猫への愛情や接触時間を増加させる可能性が示唆されたものの、感染陽性者がわずか 2 名にとどまったため統計的検出力が不足し、結論を導くにはさらなる研究が必要である。