350 件の論文
進化生物学は、生命がどのように時間とともに変化し、多様な姿を形成してきたかを解き明かす分野です。遺伝子の働きから種間の関係まで、過去の証拠と現在の観察を結びつけることで、私たちの存在のルーツに迫ります。
Gist.Science は、bioRxiv から投稿される進化生物学の新しいプレプリントをすべて収集し、専門用語を噛み砕いた解説と、技術的な詳細をまとめた要約の両方をご用意しています。これにより、専門家だけでなく広く一般の方々が、最先端の研究成果をスムーズに理解できます。
以下に、進化生物学の最新プレプリントの一覧をご紹介します。
本研究は、統計学的および系統力学的なモデリングを組み合わせることで、2020年から2024年にかけての世界的なパンズーチア（家畜伝染病）におけるほとんどのH5Nx再集合株は一時的なものであった一方で、主に欧州に由来する少数の「主要な」株が、特定の野生鳥類の目における持続的な循環や、より広い宿主ニッチの検出といった生態学的要因によって広範な成功を収めたことを明らかにしている。
本研究は、流行の最前線で進化する寄生虫が、宿主の分散に対する選択が病原性の低下と感染性の向上をもたらし、最終的に流行の拡大速度を加速させるという、生態・進化的なフィードバックを経験することを実証している。
テロメアからテロメアまでの霊長類ゲノムおよびロングリードデータを利用することで、本研究は、タンデムリピートが安定化選択と方向性選択の両方の影響を受けていることを明らかにする比較枠組みを確立し、ヒトとチンパンジーを区別する神経発達および遺伝子調節における適応進化の特定のシグネチャーを提示している。
本研究は、超保存されたヒトヒストン遺伝子がAID/APOBEC酵素によって引き起こされる予想外に高い生殖細胞系列変異率を示すことを明らかにし、それが様々な疾患につながっていること、およびこれらの変異の病原性を効果的に特徴付けるためのHistMTRフレームワークを導入するものである。
本論文は、構造化された直列合体過程（structured serial coalescent）の下で、移動と合体を分離させる対合体プロセス（pairwise genealogical processes）の進化方程式を導出することにより、時空間的なゲノムデータを用いた人口統計学的推論における識別性の課題に対処し、高解像度かつ時変的な移動率を推定するための計算量的に扱いやすい推論フレームワークを提案するものである。
本研究は、システインに富むリピート（CysRReps）を、多様な細菌、古細菌、およびウイルスから真核生物への広範な水平遺伝子伝播を辿る普遍的な分子マーカーとして特定しており、これはドメインを越えた遺伝子交換を促進する共通のメカニズムを示唆している。
本研究は、*Ipomoea hederacea*におけるアントシアニン欠損の特異的な遺伝的原因として、BZ1遺伝子の稀な劣性欠失を特定しており、他のフラボノイド経路への混同的な影響を受けることなく、アントシアニン生合成の適応度への影響を単離して研究するための独自のモデルを提供するものである。
単一細胞発現データと生物物理学的モデリングを統合することにより、本研究は、遺伝子発現パラメータは平均レベルを維持するために協調的な進化系統ドリフトを通じて進化する一方で、転写バースト率は、発現ノイズを最小限に抑える必要性によって駆動されると思われる強い選択的制約を受けていることを示している。
本研究は、絶滅危惧種であるデビルズホール・パフィンフィッシュが、極めて低い遺伝的多様性と長期にわたる小規模な個体群サイズに起因する高い固定された遺伝的負荷にもかかわらず、近親交配および心筋症に関連する変異を含む特定の劣性致死ハプロタイプによって引き起こされる著しい胚の早期死亡に引き続き苦しんでいることを明らかにしている。
本論文は、系統学的推論と直接結合解析（Direct Coupling Analysis）を統合してエピスタシス的制約を課すことにより、従来の独立サイトモデルの限界を克服し、より正確で機能的に妥当な祖先タンパク質アンサンブルを生成する、共進化を考慮した祖先配列復元フレームワークを導入するものである。